（一）投资方式
目前，沼气行业发展仍依靠国家政策支持和政府投资，投资方式主要是根据项目进行补贴。即先申报项目，项目通过审批后，国家为项目拨款。这种投资方式的优点是，根据国家预算确定每年建设多少沼气项目。但是也存在一些问题，例如申报项目是否真实存在，项目建成之后工程质量如何，使用情况怎样，有无售后服务都无从探究。若了解申报项目的真实情况，又需要投入新的成本和精力。
其他国家采取的方式则是后补助方式，即补效益和产品，这种方式值得借鉴。但是必须具备三个前提条件。第一，必须有明确和稳定的政策，新产品研发出来后，能拿到什么样的补贴，要有明确的标准，而且这个政策必须具有法律效应；第二，要有足够的资金保障，这需要对沼气产业的产能有准确判断；第三，这种补贴政策可以有效吸引投资者，使社会资本认为“有利可图”。以我国为例，为鼓励生物质能发电，国家在当地脱硫标杆电价的基础上，每千瓦?时电补贴0.25元，在这种情况下，投资者首先要考虑可以建设多大的工程，该项工程可以生产多少电能，可以获得国家多少补贴，最后还要考虑谁将购买这部分电能。这些方面都考虑清楚后，如果觉得合算，投资者则进行投资，政府有法律规定和资金保证，投资者就比较愿意进行投资建设，而且工程建成以后，投资者会想方设法地让工程持续运行下去，并从中获利。这是一种比较合理有效的方式，这也是项目真正发挥效益比较好的做法。
根据我国农村沼气建设的特殊情况，短时间内采用后补助方式存在一定的实施难度，目前主要还是采取补贴项目的方式。原因有以下几个方面，首先，政府必须有政策和资金方面的保障，另外投资者和用户也必须具有一定的物质和资金条件。其次，市场还不太成熟、终端用户受制约。尤其是农村户用沼气大多面向中等以下生活水平的农村百姓，甚至贫困人口，富裕人口更愿意选择方便的能源。另外，这种模式需要办理一系列认证、报销等手续，因此更没有多少人愿意投资建设沼气池。最后，风险控制能力不足，如果采用这种效益后补助方式，大批企业都来建设沼气项目，在国家没有足够的资金保障时，投资沼气建设而及时获得产品补助则存在相当大的风险。
在当前的补贴方式下，我国投资推广和支持的重点虽然仍然以户用沼气为主，但投资结构已经发生了一些变化。2007年之前，国家在沼气方面的投资绝大部分都用于户用沼气建设。随着农村经济社会发展以及农业产业结构调整，部分户用养殖模式逐渐转移到养殖小区、集约化养殖企业，这样使得部分户用沼气没有了原料，很多资源集中到养殖厂区、集约化养殖企业。针对这些情况，国家开始支持大中型沼气工程，目前国家投资沼气建设用于户用沼气的投资比例大概50%，20%-30%用于服务体系建设，其余用于大中型沼气工程。从国家投资结构的变化情况来看，大中型沼气工程发展势头强劲。
（二）市场空间
随着对环保的逐渐加强，人们不断利用各种方式来减少工农业生产对环境的破坏。生物质资源的利用越来越受到重视，近10年来得到较快发展，已建成2万多个大中型沼气工程，其中包括处理畜禽粪便及各种生产、生活污水、垃圾填埋等方法产生的沼气。
我国工业发展给沼气提供了丰富的原料--工业废水。我国目前发酵工业主要包括以味精为代表的氨基酸类、以柠檬酸为代表的发酵有机酸类、淀粉糖、酶制剂、酵母以及发酵甘油和特种功能发酵制品。在发酵企业排出的废物中，以发酵产生的有机废水危害最大。经过厌氧处理、随着废水化学需氧量COD的降低，废水的无害化处理可以产生大量沼气（每消耗一吨COD大约要产生沼气0.55-0.65m3）。另外，我国每年还有大量沼气源于城市垃圾填埋。
随着沼气建设发展与沼气产量的不断增加，沼气的利用已经从传统意义上的取暖、炊事和照明等，逐步向沼气发电这一新兴领域发展，而且发展速度很快。
到2020年，我国工业伴生沼气的潜力将为215亿立方米，是2001年的2倍；农业沼气潜力将达到200亿立方米。如全用于发电，按每立方米沼气发电1.6度计算，仅工农业产生的沼气发电量就超过660亿度。今后，沼气热电联产将会有很大的发展空间。
